Публикации в журнале «Фармакокинетика и Фармакодинамика» входят в системы расчётов индексов цитирования авторов и журналов.

«Индекс цитирования» — числовой показатель, характеризующий значимость данной статьи и вычисляющийся на основе последующих публикаций, ссылающихся на данную работу.

Журнал индексируется в системах: Российский индекс научного цитирования — библиографический и реферативный указатель, реализованный в виде базы данных, аккумулирующий информацию о публикациях российских учёных в российских и зарубежных научных изданиях. Проект РИНЦ разрабатывается с 2005 года компанией «Научная электронная библиотека» (www.elibrary.ru). На платформе elibrary к 2012 году размещено более 2400 отечественных журналов, в том числе и наш журнал http://elibrary.ru/title_about.asp?id=48970.